说明

密码子存在简并性，从蛋白质序列回溯DNA序列时，存在多种可能性。如果核酸序列中存在宿主的稀有密码子，就会影响蛋白质的表达水平，原理 参见《密码子优化》。本工具在生成核酸序列时， 考虑了稀有密码子的影响，如果你选择密码子优化，程序会自动过滤掉宿主的稀有密码子，同时程序会尽可能按照频率均匀的使用剩余密码子， 因为全部选择高频密码子会增加宿主的表达压力，反而不利于提高蛋白质的可溶性表达水平。本程序认定稀有密码子的原则是：根据物种密码子表， 同时满足2个条件：（1）出现频率低于全部密码子平均频率的1/2；（2）出现频率低于同义密码子平均频率的1/2。